Wenn ein Neustart nicht hilft, evtl. das NAS zurücksetzen: Dashboard Einstellungen->Hilfsprogramm->Werkseinstellungen NUR SYSTEM
Wenn das auch nichts nützt, müsste man evtl. mal per SSH nachschauen, was alles gemountet ist.
Vielleicht kann ja ein Linux-Profi mal was dazu sagen, wo die USB-Laufkwerk-Mounts gespeichert sind und wie man sie zurücksetzt/löscht.
Edit
Schau mal hier (Beitrag von jamalaya): http://community.wd.com/t5/WD-My-Cloud/USB-Drive-not-seen-by-My-Cloud-Drive/m-p/865195/highlight/true#M32097
