No aparecen los archivos pero el disco esta lleno

Estoy usando un disco de 1 TB MyNotebook. Tengo el problema de que no muestra los archivos ni en windows ni en mac, pero si muestra el espacio total ocupado por los archivos que no aparecen.
Esto ocurre cuando de usa el disco con windows y mac, después de hacerlo en varias ocasiones, deja de funcionar para ambos.
Pero si lo conecto en Linux (Ubuntu), si puedo ver los archivos.

Quiero saber como reparar este problema, ya que utilizar las utilerías que trae el disco, no sirven para nada.